时秀元却听闻伽倻山城义兵四起，对粮道构成威胁，于是便命锅岛父子率所部七千人南下平叛，顺带驻守昌原；其余诸将则按照原计划继续向北推进，争取三日内抵达清州城下。

听闻明军一溃千里，麻贵坐不住了，立即召见朝鲜领议政柳成龙，让他吩咐朝鲜水军即刻出击，切断日军海上粮道，为明军争取时间。柳成龙欣然领命，南原之战让明朝丢了脸面，如果这时候朝鲜水军能取得胜利，今后联军的发言权也会进一步的提升，到那时，朝鲜军队就不单单是明军手上的玩具、脚边的忠犬了。